More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1592 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  62.94 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.12 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 150 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  50 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  49.69 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  56.12 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  51.63 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  58.27 
 
 		 155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  54.93 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  54.93 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  53.59 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  55.63 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  50.98 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  55.63 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  53.55 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  57.66 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  52.32 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  57.55 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  56.83 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  58.27 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  54.23 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  56.93 
 
 		 151 aa  157  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  50.65 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 182 aa  155  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  50 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  48.43 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  54.93 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  48.43 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  58.91 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  47.47 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  49.37 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.47 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>