189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0079 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
188 aa  364  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  26.7 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  25 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  26.63 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  27.38 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  41.67 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  27.38 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 
205 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  28.99 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  35.06 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  28.82 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  28.82 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  35.06 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  48.39 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
207 aa  55.1  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  21.02 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28.89 
 
 
228 aa  54.7  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  19.39 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
186 aa  54.7  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  32.86 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  28.73 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  24 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  26.86 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  28.42 
 
 
185 aa  51.2  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  39.34 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  22.4 
 
 
243 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  48.44 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  19.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  26.14 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  41.38 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  19.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  19.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
273 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  42.86 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  27.27 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  26 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
288 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  31.06 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
225 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>