More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3140 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  95.45 
 
 
242 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  94.98 
 
 
242 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  94.19 
 
 
241 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  92.86 
 
 
242 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  95.04 
 
 
242 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  95.04 
 
 
242 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  53.64 
 
 
232 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  49.11 
 
 
244 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  49.11 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
267 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
229 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  50.89 
 
 
247 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
257 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
253 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 
224 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
235 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
234 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
245 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
234 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 
229 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
396 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
221 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 
233 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 
229 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 
231 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
235 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
225 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
227 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
246 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
233 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
231 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  33.16 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
224 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
224 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
224 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.1 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  31.31 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
221 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
243 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  32.45 
 
 
237 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>