More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3887 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  840    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  94.44 
 
 		 432 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  63.08 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  56.02 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  58.65 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  59.14 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  50.6 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 444 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.13 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 434 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 428 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  39.42 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 440 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  35.92 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 474 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.13 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 438 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.12 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.33 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.67 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 450 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.15 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  23.13 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  23.13 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  23.13 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  23.54 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 410 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  23.73 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  23.13 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 433 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.62 
 
 		 447 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  22.45 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>