More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1427 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 776 aa  1563    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  36.09 
 
 		 799 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 777 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 777 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.88 
 
 		 784 aa  217  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 828 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  26.55 
 
 		 759 aa  193  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  26.73 
 
 		 751 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 829 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  28.94 
 
 		 766 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 797 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  28.54 
 
 		 795 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 795 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 795 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 797 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 797 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 797 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 797 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 797 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 797 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 795 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.03 
 
 		 757 aa  180  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 795 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 795 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 819 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 785 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 799 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  30.59 
 
 		 789 aa  174  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 854 aa  137  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  39.27 
 
 		 406 aa  131  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 513 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  37.61 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 458 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  38.36 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.9 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 815 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  37.78 
 
 		 639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  36.82 
 
 		 409 aa  118  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  23.78 
 
 		 565 aa  118  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1352 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  33.01 
 
 		 391 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  26.25 
 
 		 336 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  37.56 
 
 		 412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 377 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  34.7 
 
 		 257 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  35.74 
 
 		 415 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  32.92 
 
 		 347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  31.83 
 
 		 393 aa  115  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 310 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  28.51 
 
 		 473 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 584 aa  115  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  34.09 
 
 		 906 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 600 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 468 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 607 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  40.12 
 
 		 410 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 584 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 369 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  25.86 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  36.24 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  32.65 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  33.62 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 418 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 460 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  28.94 
 
 		 363 aa  112  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 418 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  30.37 
 
 		 433 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 828 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.67 
 
 		 397 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 592 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 377 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  35.02 
 
 		 460 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  34.84 
 
 		 438 aa  111  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  34.23 
 
 		 392 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 438 aa  111  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 363 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  33.48 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  28.47 
 
 		 551 aa  109  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.27 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  35.96 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  34.53 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  26.97 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  32.09 
 
 		 484 aa  108  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  28.64 
 
 		 310 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 584 aa  108  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 377 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 556 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  32.19 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 597 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  34.39 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>