More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0776 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  98.71 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  97.42 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  90.56 
 
 
233 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  90.13 
 
 
233 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  90.13 
 
 
233 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  89.7 
 
 
233 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  90.13 
 
 
233 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  89.7 
 
 
233 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  89.27 
 
 
233 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  87.98 
 
 
233 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  87.55 
 
 
233 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  84.55 
 
 
233 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  75.86 
 
 
237 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  75.86 
 
 
237 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  75 
 
 
236 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  72.96 
 
 
233 aa  334  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.95 
 
 
233 aa  324  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  65.67 
 
 
237 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
237 aa  322  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  65.67 
 
 
237 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
233 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
237 aa  322  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
241 aa  322  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 
233 aa  321  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
237 aa  321  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  65.67 
 
 
237 aa  321  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 
233 aa  321  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
237 aa  320  9.000000000000001e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 
233 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  64.81 
 
 
233 aa  317  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  64.81 
 
 
233 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  64.81 
 
 
233 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  65.67 
 
 
233 aa  315  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  66.24 
 
 
240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  65.24 
 
 
233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  62.23 
 
 
233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  65.24 
 
 
233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 
233 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0232  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 
233 aa  301  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.54 
 
 
243 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  62.39 
 
 
238 aa  298  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  60.68 
 
 
247 aa  294  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  61.11 
 
 
241 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
248 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  64.81 
 
 
233 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  61.11 
 
 
257 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  59.4 
 
 
244 aa  292  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  63.09 
 
 
233 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  60.26 
 
 
247 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.66 
 
 
233 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  62.66 
 
 
233 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  62.66 
 
 
233 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  59.23 
 
 
235 aa  288  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  62.23 
 
 
233 aa  287  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  58.55 
 
 
248 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  57.69 
 
 
238 aa  284  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  60.68 
 
 
265 aa  284  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
243 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  59.4 
 
 
258 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  59.4 
 
 
294 aa  279  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  58.97 
 
 
258 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
235 aa  278  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  59.05 
 
 
238 aa  278  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  59.92 
 
 
246 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  59.32 
 
 
246 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  59.4 
 
 
245 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
245 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  57.69 
 
 
236 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  53.42 
 
 
234 aa  274  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
238 aa  274  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  58.05 
 
 
244 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  56.65 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  57.76 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  54.94 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  55.36 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.94 
 
 
234 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
259 aa  272  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  57.63 
 
 
244 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  55.79 
 
 
238 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 
236 aa  270  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  57.51 
 
 
233 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  55.98 
 
 
243 aa  270  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 
234 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.56 
 
 
235 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  55.79 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  57.51 
 
 
237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.13 
 
 
234 aa  268  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  54.08 
 
 
239 aa  268  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
234 aa  266  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  57.76 
 
 
242 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  55.36 
 
 
238 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  53.22 
 
 
237 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>