More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1675 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  100 
 
 
1154 aa  2319    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  45.44 
 
 
865 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.48 
 
 
764 aa  759    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  42.37 
 
 
790 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  49.08 
 
 
803 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  49.46 
 
 
481 aa  482  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  42.26 
 
 
549 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  43.64 
 
 
547 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  43.05 
 
 
548 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.86 
 
 
550 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  44.37 
 
 
537 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.37 
 
 
545 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  42.83 
 
 
548 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  43.79 
 
 
542 aa  380  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.61 
 
 
541 aa  380  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  42.83 
 
 
548 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.41 
 
 
550 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  42.83 
 
 
548 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.24 
 
 
548 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.57 
 
 
552 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  42.89 
 
 
545 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.83 
 
 
552 aa  376  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.91 
 
 
525 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  42.89 
 
 
530 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.01 
 
 
542 aa  369  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4311  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  35.09 
 
 
1055 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  42.27 
 
 
556 aa  366  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  41.53 
 
 
542 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  41.13 
 
 
532 aa  363  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  43.44 
 
 
542 aa  359  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  40.91 
 
 
531 aa  358  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  42.3 
 
 
554 aa  349  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  41.87 
 
 
554 aa  348  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  42.51 
 
 
557 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  45.16 
 
 
550 aa  345  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.86 
 
 
553 aa  341  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  42.6 
 
 
526 aa  341  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.51 
 
 
554 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.39 
 
 
554 aa  337  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  41.56 
 
 
477 aa  337  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3093  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.38 
 
 
410 aa  311  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  39.14 
 
 
539 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1125  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  50 
 
 
452 aa  288  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0174  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  50 
 
 
452 aa  288  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0451  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  50 
 
 
452 aa  288  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0265499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1434  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  52.43 
 
 
377 aa  288  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2616  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  51.4 
 
 
390 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0488176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1389  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  51.4 
 
 
390 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1209  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  51.4 
 
 
394 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.059657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1475  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.35 
 
 
437 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00398178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  47.27 
 
 
2284 aa  260  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1433  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.12 
 
 
623 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2602  putative acyltransferase  46.62 
 
 
282 aa  244  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2512  putative acyltransferase  46.62 
 
 
282 aa  244  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.21 
 
 
309 aa  231  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2098  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.25 
 
 
299 aa  227  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.476029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2977  putative acyltransferase  45.66 
 
 
264 aa  221  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  hitchhiker  0.0000388716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.86 
 
 
309 aa  220  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.48 
 
 
313 aa  219  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2986  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.41 
 
 
319 aa  217  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0669081  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.61 
 
 
314 aa  207  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0013  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.98 
 
 
306 aa  207  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3106  acyl transferase domain-containing protein  36.48 
 
 
321 aa  204  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3818  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.67 
 
 
313 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000579966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1458  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.71 
 
 
299 aa  201  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1850  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.71 
 
 
299 aa  201  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0428  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.71 
 
 
299 aa  201  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0839  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.71 
 
 
299 aa  201  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.71 
 
 
299 aa  201  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.582901  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0138  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.28 
 
 
293 aa  201  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.488001 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0524  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.37 
 
 
299 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5012  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.05 
 
 
291 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3469  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.01 
 
 
324 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122116  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1437  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.48 
 
 
304 aa  196  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3966  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.05 
 
 
292 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147046  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0711  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.49 
 
 
307 aa  196  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000405607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0176  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.42 
 
 
304 aa  195  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.14 
 
 
314 aa  194  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4158  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  41.34 
 
 
312 aa  194  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.05 
 
 
313 aa  194  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0336623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1179  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.73 
 
 
312 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000714378  decreased coverage  0.00161163 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1646  malonyl CoA-ACP transacylase  42.37 
 
 
317 aa  191  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.918614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0181  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.81 
 
 
303 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0124548  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1158  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.89 
 
 
301 aa  190  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00125697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3951  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.75 
 
 
314 aa  190  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1491  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.36 
 
 
324 aa  191  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1213  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.41 
 
 
309 aa  191  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0168  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.77 
 
 
302 aa  190  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3833  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.64 
 
 
312 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3675  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.66 
 
 
314 aa  188  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0879975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14910  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.46 
 
 
312 aa  188  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1589  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.03 
 
 
317 aa  187  9e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1343  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.56 
 
 
319 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.374742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.62 
 
 
311 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02708  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 
314 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1292  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.05 
 
 
314 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.785479  hitchhiker  0.0000000000409846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1971  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.4 
 
 
313 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3285  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.78 
 
 
306 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2491  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  39.24 
 
 
302 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1646  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.28 
 
 
312 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312086  normal  0.20573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>