More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0059 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0059  AraC family transcription regulator  100 
 
 		 404 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0070  AraC family transcriptional regulator  90.44 
 
 		 406 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0068  AraC family transcriptional regulator  90.02 
 
 		 409 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3481  transcriptional regulator  95.57 
 
 		 336 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1826  AraC/XylS family transcription factor  95.57 
 
 		 336 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2727  AraC family transcription regulator  95.57 
 
 		 336 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0284  AraC family transcription regulator  90.99 
 
 		 333 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4926  transcriptional regulator, AraC family  70.12 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.949347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3849  transcriptional regulator, AraC family  70.12 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 334 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  28.2 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 306 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 336 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  27.99 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 330 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 330 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 341 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 341 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 332 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  25.9 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  31 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.7 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  28 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  30.84 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 317 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  29.07 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  27.72 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 316 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 315 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 318 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 325 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 342 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  31.43 
 
 		 350 aa  97.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 314 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 323 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 323 aa  96.3  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  29.24 
 
 		 320 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>