More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4926 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3849  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 339 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4926  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 339 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.949347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0059  AraC family transcription regulator  70.12 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0070  AraC family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0068  AraC family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1826  AraC/XylS family transcription factor  71.61 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3481  transcriptional regulator  71.61 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2727  AraC family transcription regulator  71.61 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0284  AraC family transcription regulator  71.33 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  26.71 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  32.17 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  28.3 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 375 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  27.72 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 340 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2921  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  29.04 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  33.45 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 437 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 318 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  33.18 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>