More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3283 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  60.77 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  63.86 
 
 		 280 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  61.25 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  62.7 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  57.96 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  58.94 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  61.79 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  58.54 
 
 		 282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  62.5 
 
 		 281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  62.1 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  55.6 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  61.69 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  62.1 
 
 		 279 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  62.1 
 
 		 279 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  62.1 
 
 		 279 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  60.89 
 
 		 279 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  60.41 
 
 		 279 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  60.41 
 
 		 279 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  56.73 
 
 		 281 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  59.47 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  59.5 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  55.56 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  54.62 
 
 		 271 aa  278  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  59.17 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  53.22 
 
 		 271 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  54.2 
 
 		 301 aa  245  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  51.64 
 
 		 301 aa  241  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  44.09 
 
 		 279 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  50.86 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  60.54 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  48.35 
 
 		 280 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  48.76 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  43.85 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  43.67 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  47.26 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  46.19 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  42.11 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  39.92 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.2 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  39.53 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  40.2 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  35.29 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  36.69 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  36.89 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  38.91 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  39.61 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.93 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  39.71 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.93 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  37.5 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  34.21 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  40.1 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  36.82 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  37.44 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  36.71 
 
 		 322 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  36.29 
 
 		 331 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  34.19 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  34.62 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  34.19 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  34.84 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  36.32 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  37.56 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  31.3 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  33.91 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.62 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  34.19 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  34.19 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  38.16 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  36.55 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  31.06 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  33.64 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  32.24 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  34.06 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  33.97 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  37.62 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  34.62 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  32.91 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  32.9 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  32.91 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.97 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  45.33 
 
 		 205 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  36.54 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  34.09 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  32.48 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  34.76 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  34.19 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  34.19 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  32.81 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  32.05 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  34.29 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  32.05 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  34.1 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  32.05 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  35.35 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>