89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1215 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  38.1 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  35.96 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  34.63 
 
 
230 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  34.63 
 
 
230 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  34.16 
 
 
229 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  32.87 
 
 
228 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  31.71 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  32.79 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  32.38 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  33.2 
 
 
229 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.62 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  27.82 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  26.71 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.22 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  24.3 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  26.34 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  25.42 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  33.62 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  26.85 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  33.62 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  25.11 
 
 
232 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  25.93 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  25.51 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  35.19 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  24.36 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  26.23 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  31.58 
 
 
201 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  29.08 
 
 
211 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  26.67 
 
 
205 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  31.25 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  24.45 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.25 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  25.42 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  25.84 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  28.87 
 
 
211 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  30.63 
 
 
212 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  33.33 
 
 
212 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  24.64 
 
 
244 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  26.98 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.63 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  24.18 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  39.68 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  24.55 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  30.4 
 
 
638 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  24.35 
 
 
661 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  25.45 
 
 
703 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  24.65 
 
 
240 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  29.73 
 
 
206 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  25.45 
 
 
703 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  24.35 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  23.4 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  24.41 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  23.41 
 
 
692 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  28.83 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  24.47 
 
 
193 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.87 
 
 
598 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  25.5 
 
 
645 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  24.17 
 
 
997 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.54 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  24.58 
 
 
207 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  23.87 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  25.26 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  25.82 
 
 
449 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.73 
 
 
206 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  25.91 
 
 
703 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  28.83 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  24.83 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  24.15 
 
 
674 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1310  hypothetical protein  24.58 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  22.45 
 
 
255 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  23.74 
 
 
710 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  24.14 
 
 
689 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  26.75 
 
 
454 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  27.06 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.03 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  30.53 
 
 
708 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  25.89 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  29.73 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  30.91 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  26.64 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3911  hypothetical protein  24.58 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  22.18 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2970  hypothetical protein  24.44 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  27.43 
 
 
665 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  21.05 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  29.73 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  20.56 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.7 
 
 
243 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>