54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2970 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2970  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1117  hypothetical protein  53.38 
 
 		 274 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4795  outer membrane insertion C-terminal signal  50 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.814191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4110  hypothetical protein  48.94 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1310  hypothetical protein  49.47 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3911  hypothetical protein  49.07 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1819  hypothetical protein  35.23 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  29.22 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  28.15 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3063  porin  28.62 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4340  porin  28.85 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4835  porin  29.17 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4552  porin  26.06 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.477499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.19 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  28.52 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  30.43 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  26.09 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  26.22 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  26.22 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  26.88 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  25.49 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  27.78 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  28.89 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  23.53 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  26.72 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  26.7 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  32 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  27.36 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  27.48 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  30.73 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  23.1 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  27.75 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  25.77 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  23.37 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  26.42 
 
 		 703 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  25.84 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  25.59 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  26.42 
 
 		 703 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  26.89 
 
 		 703 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  25.51 
 
 		 236 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  25.58 
 
 		 583 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  21.95 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  27.74 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  21.82 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  24.1 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.73 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  22.58 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  33.33 
 
 		 449 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  24.6 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  24.44 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  27.04 
 
 		 452 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  23.23 
 
 		 213 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  30.72 
 
 		 449 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  22.13 
 
 		 228 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>