More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0712 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  100 
 
 		 617 aa  1261    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  43.4 
 
 		 600 aa  360  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.19 
 
 		 595 aa  359  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  41.4 
 
 		 604 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.98 
 
 		 596 aa  336  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  41.26 
 
 		 599 aa  324  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.33 
 
 		 588 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.41 
 
 		 605 aa  318  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.94 
 
 		 595 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.94 
 
 		 595 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.38 
 
 		 587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.15 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.56 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.15 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.15 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.15 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.15 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.15 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.51 
 
 		 600 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.28 
 
 		 601 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.48 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.38 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.98 
 
 		 598 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.8 
 
 		 598 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  33.72 
 
 		 599 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.8 
 
 		 598 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  37.3 
 
 		 544 aa  300  5e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.78 
 
 		 599 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.97 
 
 		 626 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  37.91 
 
 		 593 aa  293  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.9 
 
 		 614 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.53 
 
 		 583 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.34 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  40.88 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  32.57 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  38.05 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.73 
 
 		 652 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.5 
 
 		 651 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.62 
 
 		 614 aa  279  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.04 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  40.63 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  33.83 
 
 		 586 aa  278  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.04 
 
 		 655 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38.11 
 
 		 656 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.34 
 
 		 660 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.99 
 
 		 656 aa  277  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.34 
 
 		 660 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.11 
 
 		 660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.15 
 
 		 652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  35.08 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  39.2 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.14 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.01 
 
 		 663 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  40.21 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  41.27 
 
 		 578 aa  273  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.12 
 
 		 674 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.06 
 
 		 663 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  37.91 
 
 		 666 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.52 
 
 		 660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  32.26 
 
 		 653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.9 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  40.62 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  30.2 
 
 		 598 aa  270  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.3 
 
 		 574 aa  270  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  39.53 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  40.9 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  41.19 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  40.73 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  36.11 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  35.71 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  39.53 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.45 
 
 		 613 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  39.3 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.1 
 
 		 619 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  35.88 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  39.3 
 
 		 574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  36.79 
 
 		 651 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  35.07 
 
 		 565 aa  267  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  36.25 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  36.25 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  36.25 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.25 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.83 
 
 		 664 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.98 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  36.25 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  39.03 
 
 		 576 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  39.05 
 
 		 574 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  36.07 
 
 		 594 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.45 
 
 		 584 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  41.3 
 
 		 575 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  30.39 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  36.5 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>