More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0505 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  62.85 
 
 		 517 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 507 aa  1021    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  70.38 
 
 		 508 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  64.39 
 
 		 525 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  61.26 
 
 		 505 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  61.95 
 
 		 503 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  61.51 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 532 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  61.03 
 
 		 515 aa  609  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  58.63 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  58.35 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  58.15 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  57.95 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  56.97 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  58.37 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  57.43 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  59.04 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  56.3 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  56.18 
 
 		 518 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  57.6 
 
 		 499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  57.29 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  57.46 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  57.49 
 
 		 511 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  59.48 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  59.04 
 
 		 515 aa  568  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  58.08 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  57.29 
 
 		 516 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  57.8 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  56.49 
 
 		 515 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 		 519 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 510 aa  568  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  57.43 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 		 504 aa  559  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  57.71 
 
 		 513 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  57.72 
 
 		 516 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 		 536 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 		 503 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  56.83 
 
 		 515 aa  552  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  56.64 
 
 		 541 aa  552  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  56.74 
 
 		 510 aa  551  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  56.6 
 
 		 515 aa  549  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  56 
 
 		 515 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 		 514 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  56.14 
 
 		 531 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 514 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  55.8 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  55.33 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  54.72 
 
 		 536 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  56.94 
 
 		 506 aa  542  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  52.36 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  54.72 
 
 		 536 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  52.33 
 
 		 556 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  53.88 
 
 		 522 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 540 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  54.91 
 
 		 530 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  54.55 
 
 		 541 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 		 556 aa  538  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  52.87 
 
 		 522 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  53.07 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  56.66 
 
 		 504 aa  534  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  54.44 
 
 		 506 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  55.17 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 504 aa  528  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  51.38 
 
 		 523 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 506 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  51.58 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  52.42 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  51.58 
 
 		 523 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  54.95 
 
 		 517 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  54.53 
 
 		 527 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 		 546 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 518 aa  528  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 		 522 aa  525  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 515 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  54.44 
 
 		 515 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  53.56 
 
 		 523 aa  521  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.74 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  52.69 
 
 		 532 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  52.89 
 
 		 532 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 505 aa  519  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>