208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0680 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  81.4 
 
 		 202 aa  290  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  59.44 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  61.05 
 
 		 222 aa  207  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  59.41 
 
 		 200 aa  203  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  56.98 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  59.52 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  57.22 
 
 		 242 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  51.74 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  43.24 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  37.29 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  34.91 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  33.95 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  29.82 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  30.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.36 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  32.31 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.75 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  28.9 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  29.1 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  29.61 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  35.09 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  45.07 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  34.4 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  23.53 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  27.75 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  40.85 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  22.41 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  33.66 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  30.7 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  25.15 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  29.82 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  29.82 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  42.25 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  28.25 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  33.61 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  38.67 
 
 		 250 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  28.38 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  33.71 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  33.71 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  29.71 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 325 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  27.81 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>