More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3408 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  100 
 
 
573 aa  1057    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.43 
 
 
581 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  70.26 
 
 
581 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  69.91 
 
 
581 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
594 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
610 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
738 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  40.86 
 
 
748 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
516 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
746 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
737 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
756 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
516 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  42.16 
 
 
516 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
756 aa  187  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
748 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 
508 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
518 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
752 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  36.34 
 
 
500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  32.12 
 
 
1230 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
718 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  33.53 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  32.31 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  26.55 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
488 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
736 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  45.26 
 
 
710 aa  173  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  34.83 
 
 
484 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
731 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
741 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
532 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  40.13 
 
 
1347 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
655 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
756 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
662 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
494 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  35.26 
 
 
517 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  39.01 
 
 
490 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  43.56 
 
 
705 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
491 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1130  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.351901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1199  histidine kinase  42.71 
 
 
525 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.893151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  31.54 
 
 
581 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1071  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
498 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
742 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
733 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  43.48 
 
 
734 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
763 aa  160  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
749 aa  160  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  31.21 
 
 
1255 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 
525 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
708 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
753 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
760 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
540 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  28.08 
 
 
484 aa  158  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
745 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  34.54 
 
 
487 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 
525 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
744 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  40.52 
 
 
712 aa  157  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
779 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  33.33 
 
 
499 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
515 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
814 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
1519 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
592 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
725 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
736 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34.55 
 
 
548 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  34.35 
 
 
592 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
763 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
752 aa  154  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
736 aa  153  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
781 aa  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  30.13 
 
 
673 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
671 aa  153  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
575 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
548 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  37.55 
 
 
774 aa  153  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  31.54 
 
 
674 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
755 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
733 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  38.56 
 
 
774 aa  153  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
729 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
799 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  35.76 
 
 
655 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
784 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
775 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0701  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
545 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
656 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
771 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
756 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>