More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0663 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  100 
 
 		 346 aa  701    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  69.28 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.09 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  65.95 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  61.42 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  64.06 
 
 		 364 aa  424  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  62.31 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  62.58 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  61.14 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  61.61 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  59.36 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  59.4 
 
 		 418 aa  417  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  60.77 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  61.47 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  61.47 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  60.74 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  61.92 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  64.74 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  60.8 
 
 		 348 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  62.5 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  59.82 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  57.69 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  63.69 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  63.35 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  61.85 
 
 		 364 aa  411  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  62.02 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  59.63 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  56.89 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  66.15 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  60.8 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  61.44 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  64.17 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  60.49 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  59.26 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  63.35 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  61.73 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  62.35 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  60.19 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  60.19 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  60.18 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  64.84 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.61 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  58.48 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  61.99 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  61.68 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  64.38 
 
 		 336 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  58.54 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  61.37 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  61.76 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  63.98 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  59.29 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  58.97 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  58.54 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  58.59 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  61.72 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  59.09 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  59.27 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  60.12 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  58.54 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  60.75 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.37 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  60.56 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  60.19 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  59.57 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  60.75 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  58.7 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.8 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  58.79 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  58.9 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  58.72 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  58.72 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  59.13 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  59.13 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  59.13 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  60.75 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  57.77 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  58.64 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  59.02 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  59.26 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  58.59 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  61.08 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  62.7 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  61.06 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  61.37 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  57.99 
 
 		 358 aa  401  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.15 
 
 		 364 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  59.08 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  58.64 
 
 		 347 aa  401  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  58.54 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  61.37 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  60.75 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  58.56 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  61.02 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  62.7 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  60.12 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  60.37 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  60.66 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  59.02 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  62.62 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  60.56 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>