More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7065 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  37.7 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  47.35 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  36.68 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  41.45 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 319 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  40.17 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  39.71 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  34 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02773  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  38.8 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1309  transcriptional activator MetR  29.89 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00130868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.25 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0860  transcriptional activator MetR  26.86 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  32.92 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  30.54 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  37.39 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>