More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6694 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  100 
 
 		 413 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  53.83 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  54.01 
 
 		 409 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  48.79 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  52.63 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  53.03 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  50.13 
 
 		 425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  49.52 
 
 		 469 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  50.13 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  50.12 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  50.61 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  47.5 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  45.95 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  50.12 
 
 		 433 aa  272  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  41.79 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  43.17 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  39.95 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  46.32 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  38.18 
 
 		 483 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  48.45 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  33.84 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.75 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  33.41 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.5 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.25 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  43.82 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.75 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  41 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  34.65 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  30.75 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  35.68 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.64 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.25 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  41.51 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  37.93 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  41.76 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.33 
 
 		 476 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.3 
 
 		 477 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.7 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.18 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.06 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.06 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  34.61 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  42.01 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  38.11 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  42.11 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.34 
 
 		 467 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  40.07 
 
 		 399 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  25.31 
 
 		 492 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  25.31 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  38.72 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  38.72 
 
 		 399 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  31 
 
 		 495 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  38.35 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.84 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.09 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.84 
 
 		 484 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  37.19 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  38.72 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  38.72 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  38.72 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  32.82 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  28.09 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  32.82 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.59 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  28.3 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.64 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  38.35 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  38.7 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  35.88 
 
 		 398 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  38.35 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  38.46 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  39.86 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  38.29 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.87 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  37.87 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  33.96 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  38.36 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.52 
 
 		 471 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  34.48 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  24.81 
 
 		 471 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  31.68 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  39.85 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  39.44 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  42.06 
 
 		 368 aa  136  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  38.52 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  38.52 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  37.6 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  37.6 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  38.52 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  37.6 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  37.6 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>