178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0057 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
791 aa  1567  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  43.73 
 
 
916 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
774 aa  265  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
873 aa  181  6e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
3301 aa  176  1e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 
545 aa  176  1e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  38.55 
 
 
1644 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  38.55 
 
 
1644 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
671 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
725 aa  168  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
867 aa  167  6e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
392 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
392 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
414 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
856 aa  154  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  31.35 
 
 
787 aa  145  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
389 aa  144  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
404 aa  140  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
401 aa  130  8e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  32.45 
 
 
383 aa  130  1e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  31.38 
 
 
1364 aa  130  1e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
1386 aa  128  4e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
373 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
679 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
374 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
1044 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
624 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
377 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
379 aa  99.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
359 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
359 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
357 aa  94.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  29.15 
 
 
1232 aa  85.9  2e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
616 aa  82.8  2e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.89 
 
 
1219 aa  80.5  1e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
1233 aa  79  3e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  27.24 
 
 
376 aa  76.6  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  27.92 
 
 
1635 aa  75.5  4e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
332 aa  69.3  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  30.05 
 
 
542 aa  66.2  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
623 aa  64.7  6e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
344 aa  58.9  4e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
344 aa  58.2  6e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  31.9 
 
 
344 aa  57.8  9e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
995 aa  55.8  3e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
343 aa  55.5  3e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
1229 aa  55.5  3e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  33.76 
 
 
404 aa  55.5  4e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  35.22 
 
 
431 aa  55.5  4e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  25.97 
 
 
364 aa  55.1  6e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
346 aa  54.7  7e-06  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  28.69 
 
 
523 aa  54.7  7e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  32.89 
 
 
404 aa  54.3  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
384 aa  53.1  2e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
779 aa  52.4  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  33.87 
 
 
416 aa  52.4  3e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  27.75 
 
 
759 aa  52  4e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
402 aa  52  4e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  38.06 
 
 
409 aa  51.6  5e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4457  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
373 aa  51.2  7e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
383 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
380 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  25.33 
 
 
433 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
417 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 
364 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
410 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
379 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
348 aa  50.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  23.26 
 
 
339 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
380 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
384 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
367 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
373 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  21.56 
 
 
527 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
382 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
384 aa  48.9  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
381 aa  48.5  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
379 aa  48.9  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  27.13 
 
 
497 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
373 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.23 
 
 
361 aa  48.5  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
387 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  30.77 
 
 
793 aa  48.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
447 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30 
 
 
349 aa  48.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  37 
 
 
819 aa  47.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
374 aa  47.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
346 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0565  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
323 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
381 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.75186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  29.2 
 
 
615 aa  47.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
358 aa  47.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  37.76 
 
 
392 aa  47.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
871 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1745  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
358 aa  47.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
381 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
378 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
360 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
378 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>