More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0494 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  100 
 
 		 360 aa  681    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  38.41 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  35.58 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  36.7 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  36.7 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  39.51 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  39.25 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  38.15 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  31.35 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  31.03 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  34.86 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  38.04 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  28.44 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  29.25 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  37.96 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  32.83 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  31.87 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  35.67 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  35.85 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  37.73 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  27.99 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  34.7 
 
 		 329 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  27.71 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  36.59 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.5 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  35.83 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  35.47 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  35.85 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  33.65 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  33.64 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  36.36 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  33.23 
 
 		 330 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  35.51 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  32.72 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  32.72 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  35.2 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  34.39 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  32.93 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  33.33 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.12 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  32.7 
 
 		 333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.82 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  30.22 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  27.22 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  31.79 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  29.34 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.95 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  35 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.83 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  31.64 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.28 
 
 		 297 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  34.56 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  31.8 
 
 		 317 aa  89.7  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.81 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  29.9 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  27.71 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.16 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.16 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.16 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.16 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.16 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.16 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.01 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  30.26 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  29.03 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.02 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.26 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.67 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.39 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.98 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.64 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.33 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  30.93 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  29.57 
 
 		 645 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>