More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0097 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
152 aa  293  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  2.02401e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
140 aa  73.6  9e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
139 aa  73.2  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
139 aa  72.4  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
139 aa  72.4  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
139 aa  72.4  2e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
131 aa  72  3e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
131 aa  72  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
131 aa  72  3e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
131 aa  72  3e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
131 aa  72  3e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
163 aa  71.2  4e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  70.5  7e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  70.5  7e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  70.5  7e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
140 aa  70.5  7e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  70.5  8e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.29198e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  70.5  8e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  70.5  8e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.89375e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
139 aa  70.5  8e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
139 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
139 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
139 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
139 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.92908e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
145 aa  65.5  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
150 aa  64.3  5e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
153 aa  63.5  9e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
150 aa  63.5  9e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 
159 aa  61.2  5e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
141 aa  60.8  6e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
172 aa  60.1  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
142 aa  58.2  4e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  31.48 
 
 
159 aa  58.2  4e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
155 aa  57.8  5e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
142 aa  57.8  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
151 aa  57.8  6e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  52.54 
 
 
149 aa  57.4  7e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
145 aa  57.4  7e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
171 aa  57.4  7e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
173 aa  55.8  2e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
141 aa  54.7  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
149 aa  54.3  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
159 aa  54.3  6e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  35.61 
 
 
154 aa  53.9  7e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
171 aa  53.9  8e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
157 aa  53.5  9e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  53.5  9e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.14 
 
 
147 aa  53.1  1e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
165 aa  53.1  1e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  1.30168e-07 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
170 aa  53.1  1e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
172 aa  53.1  1e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
177 aa  53.5  1e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
158 aa  53.1  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 
169 aa  53.1  1e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
156 aa  52.8  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
149 aa  52.8  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
173 aa  52.4  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
146 aa  52.8  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
187 aa  52.4  2e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.8  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  27.84 
 
 
173 aa  52  3e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
147 aa  52  3e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
195 aa  52  3e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
152 aa  52  3e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.49259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  50.85 
 
 
161 aa  52  3e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
148 aa  51.6  3e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30 
 
 
176 aa  51.6  4e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
151 aa  51.6  4e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 
176 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 
176 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 
176 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 
176 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 
176 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
146 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
151 aa  51.2  5e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
152 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  7.63093e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
142 aa  50.8  6e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.90636e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
156 aa  50.8  6e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
148 aa  50.8  6e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 
176 aa  51.2  6e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.83532e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>