More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0029 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  100 
 
 
452 aa  923  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  53.69 
 
 
456 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  3.27652e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  48.99 
 
 
450 aa  448  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.68991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  49.35 
 
 
476 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.20499e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 
461 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.86349e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  44.69 
 
 
450 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.6146e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  46.64 
 
 
452 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  44.84 
 
 
447 aa  407  1e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 
453 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.46743e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  46.46 
 
 
473 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.7109e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  42.19 
 
 
457 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  42.58 
 
 
460 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  42.83 
 
 
450 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 
489 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  44.27 
 
 
458 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.51779e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  42 
 
 
489 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 
463 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 
462 aa  197  5e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  30.32 
 
 
484 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 
460 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  31.33 
 
 
477 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  33.33 
 
 
470 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
447 aa  185  2e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
485 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
476 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 
476 aa  174  4e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  32.3 
 
 
476 aa  173  4e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 
492 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  32.3 
 
 
476 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 
465 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 
476 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 
453 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 
403 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 
430 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
439 aa  156  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 
477 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
468 aa  135  1e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 
486 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 
460 aa  122  1e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 
518 aa  115  1e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 
507 aa  115  1e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 
440 aa  115  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 
434 aa  115  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
351 aa  115  2e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
499 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 
436 aa  112  2e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 
434 aa  110  4e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 
464 aa  109  9e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 
462 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 
365 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 
464 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 
467 aa  104  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 
463 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 
463 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
474 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
470 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
443 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
487 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 
496 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 
453 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 
400 aa  92.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.07878e-05  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
728 aa  91.7  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.32 
 
 
457 aa  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
429 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.29 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.87 
 
 
398 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.29 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
468 aa  87.4  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 
398 aa  86.3  1e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 
398 aa  86.3  1e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.5 
 
 
481 aa  85.9  1e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 
474 aa  86.3  1e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
471 aa  85.5  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 
477 aa  85.9  2e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 
455 aa  85.5  2e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 
405 aa  85.1  3e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  27.25 
 
 
432 aa  84.7  3e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  27.36 
 
 
473 aa  84  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 
399 aa  83.2  1e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 
391 aa  81.6  2e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 
385 aa  82  2e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 
369 aa  82  2e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.56 
 
 
385 aa  81.6  2e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.22 
 
 
446 aa  82.4  2e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.33 
 
 
391 aa  81.6  3e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.33 
 
 
391 aa  81.6  3e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.42 
 
 
385 aa  81.3  4e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.42 
 
 
385 aa  81.3  4e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 
459 aa  80.9  4e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 
385 aa  81.3  4e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 
385 aa  81.3  4e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 
385 aa  81.3  4e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 
382 aa  80.1  7e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 
385 aa  80.1  8e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
454 aa  79.7  1e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
454 aa  79.7  1e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>