More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3976 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  817    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
423 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
453 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  38.77 
 
 
441 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  37.95 
 
 
413 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.83 
 
 
447 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  37.03 
 
 
446 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
414 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.63 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
432 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.93 
 
 
474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
409 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  31.19 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  33.5 
 
 
424 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  37.89 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
418 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  31.76 
 
 
430 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
421 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.92 
 
 
418 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
433 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  35.17 
 
 
418 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
419 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  32.68 
 
 
403 aa  199  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
442 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
440 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  31.5 
 
 
436 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.22 
 
 
414 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
401 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  34.02 
 
 
474 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
421 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
428 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.92 
 
 
435 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
413 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
433 aa  186  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.75 
 
 
410 aa  186  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  32.13 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  34.34 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  30.77 
 
 
549 aa  179  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.96 
 
 
415 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
414 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
435 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.64 
 
 
426 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  31.65 
 
 
429 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
404 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  29.26 
 
 
428 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
403 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
456 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  29.17 
 
 
553 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.69 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  31.5 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
408 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
418 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
450 aa  166  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  31.12 
 
 
405 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.04 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.27 
 
 
524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  27.99 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.16 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.03 
 
 
410 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  29.77 
 
 
541 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
415 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
420 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
436 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  31.68 
 
 
532 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  31.18 
 
 
431 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.77 
 
 
446 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  31.3 
 
 
526 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
446 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
378 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
441 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  30.92 
 
 
441 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  30.1 
 
 
412 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  29.9 
 
 
418 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  29.74 
 
 
586 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
419 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  30.32 
 
 
426 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  31.02 
 
 
529 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
442 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  31.13 
 
 
532 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  30.98 
 
 
543 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  29.74 
 
 
532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.43 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  30.27 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  29.8 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  30.27 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  29.4 
 
 
409 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.34 
 
 
419 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  28.57 
 
 
419 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
417 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>