186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0590 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.55 
 
 		 239 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  40.87 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  26.04 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  26.04 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  37.19 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  27.71 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.05 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  28.27 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  24.7 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  34.75 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  32.76 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.52 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  28.22 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  35.04 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  25.88 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  25.63 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  22.64 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  27.53 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  33.05 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  25.57 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  30.16 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  27.9 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  35.04 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  30.37 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  32.58 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  30.58 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  34.38 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  25.11 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  20.08 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  31.93 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.03 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  28.48 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  26.47 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  31.93 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.08 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  26.92 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  28.7 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  28.03 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  26.53 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.13 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.13 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.13 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  29.84 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  24.88 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.45 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  28.23 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  25.11 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  25.95 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  25.95 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  24.41 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  26.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  26.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  26.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  26.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  26.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  26.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  27.45 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  27.45 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  27.45 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  27.45 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  24.41 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  24.84 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  32.63 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  22.92 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.84 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>