225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2893 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  84.7 
 
 
271 aa  477  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
275 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.14 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.17 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  34.95 
 
 
327 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.43 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.72 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.49 
 
 
349 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.34 
 
 
312 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.84 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
319 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.02 
 
 
319 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.43 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.14 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.14 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.89 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.32 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.29 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.93 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.93 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.88 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  30.77 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  29.56 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  26.39 
 
 
362 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  28.05 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25.36 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.07 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.63 
 
 
334 aa  62.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  26.02 
 
 
353 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 
314 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
351 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  22.08 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.72 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  27.13 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  31.05 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>