More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2768 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
418 aa  858    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  73.96 
 
 
411 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  70.9 
 
 
415 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  70.49 
 
 
413 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  71.01 
 
 
412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  69.81 
 
 
414 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  69.81 
 
 
414 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  69.81 
 
 
414 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 
413 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 
413 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  71.67 
 
 
417 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 
413 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  70.73 
 
 
413 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  69.76 
 
 
413 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 
413 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  68.8 
 
 
412 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  69.66 
 
 
412 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  69.66 
 
 
412 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  69.76 
 
 
415 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 
415 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  68.61 
 
 
413 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 
413 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  70.34 
 
 
414 aa  585  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  68.29 
 
 
415 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  68.22 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  67.23 
 
 
413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  67.96 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 
415 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  67.08 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  67.65 
 
 
416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  67.81 
 
 
415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 
420 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 
413 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  67.08 
 
 
413 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  65.62 
 
 
410 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 
410 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 
414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  65.05 
 
 
416 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  66.02 
 
 
422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 
412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  67.42 
 
 
415 aa  558  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
417 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 
412 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 
411 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 
417 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
425 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
424 aa  545  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 
422 aa  545  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
425 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 
419 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
427 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
417 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
417 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
414 aa  541  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
427 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 
417 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 
412 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
436 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
417 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 
413 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.96 
 
 
412 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 
439 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 
420 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 
438 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  60.33 
 
 
423 aa  529  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
412 aa  528  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 
421 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 
426 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
437 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 
438 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
431 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
427 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  60.37 
 
 
436 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 
412 aa  522  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
431 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
418 aa  521  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 
434 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 
425 aa  521  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 
438 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 
414 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
418 aa  522  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 
415 aa  520  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 
431 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 
417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 
427 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 
432 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 
436 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 
430 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 
423 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 
427 aa  518  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 
417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 
417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  63.75 
 
 
566 aa  518  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
454 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  61.34 
 
 
419 aa  518  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 
416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 
417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>