More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2264 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 363 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  51.46 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 349 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.31 
 
 		 351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.31 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.28 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.3 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.88 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.98 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.87 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  50 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  48.55 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.92 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.86 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 		 378 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.52 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.16 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 335 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 345 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.01 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.27 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.44 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.27 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  49.04 
 
 		 357 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  48.06 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  48.39 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 339 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  50.3 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.89 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 344 aa  285  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  45.5 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.43 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.93 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  45.66 
 
 		 336 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.58 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.58 
 
 		 357 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.65 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.79 
 
 		 348 aa  281  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.42 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.77 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.88 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  46.65 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.77 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  50 
 
 		 361 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 362 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.88 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 358 aa  279  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 344 aa  278  8e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.27 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.77 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  43.77 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  45.33 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  47.98 
 
 		 361 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  45.8 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.34 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  45.22 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>