More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0077 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  100 
 
 
353 aa  731  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  731  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.74 
 
 
345 aa  179  5e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  31.97 
 
 
323 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  30.98 
 
 
358 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
300 aa  119  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  40.37 
 
 
214 aa  116  7e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
286 aa  115  9e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
310 aa  113  4e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
330 aa  112  7e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
303 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
309 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
335 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.02 
 
 
306 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 
298 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.46 
 
 
672 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  29.92 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  27.99 
 
 
310 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.69 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  26.55 
 
 
248 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  8.22833e-10 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  85.5  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.26 
 
 
305 aa  82  1e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.13 
 
 
332 aa  82.4  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.56 
 
 
342 aa  80.5  4e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25 
 
 
310 aa  80.5  5e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  31.38 
 
 
273 aa  80.1  6e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  26.48 
 
 
305 aa  79  1e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  25.54 
 
 
236 aa  79  1e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.22466e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
275 aa  78.2  2e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  28.52 
 
 
607 aa  78.2  2e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
282 aa  78.6  2e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  34.62 
 
 
308 aa  77.8  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  29.78 
 
 
625 aa  77.8  3e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  28.72 
 
 
447 aa  77.4  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  28.72 
 
 
447 aa  77.4  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.83 
 
 
240 aa  77  5e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
513 aa  76.6  6e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  28.86 
 
 
285 aa  76.3  7e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  28.69 
 
 
376 aa  75.9  1e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  25.38 
 
 
312 aa  75.1  2e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
310 aa  74.3  3e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  30.29 
 
 
318 aa  73.6  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  33.93 
 
 
1046 aa  73.6  5e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 
334 aa  72.8  9e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 
314 aa  72.4  1e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  29.11 
 
 
215 aa  72  1e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  27.34 
 
 
316 aa  71.6  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  28.48 
 
 
308 aa  71.6  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
333 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.75 
 
 
277 aa  71.2  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.27 
 
 
305 aa  70.5  4e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  29.14 
 
 
318 aa  70.9  4e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
274 aa  70.5  5e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  33.33 
 
 
273 aa  70.5  5e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
1162 aa  70.1  5e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.75 
 
 
238 aa  70.1  6e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  33.96 
 
 
233 aa  70.1  6e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
265 aa  68.9  1e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  22.78 
 
 
298 aa  69.3  1e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  23.62 
 
 
274 aa  68.9  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
442 aa  68.6  2e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
233 aa  68.6  2e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  34.03 
 
 
297 aa  68.6  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  28.31 
 
 
281 aa  68.6  2e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  41.75 
 
 
272 aa  68.2  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
323 aa  68.2  2e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
323 aa  68.2  2e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
272 aa  68.2  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.74 
 
 
336 aa  67.4  3e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 
311 aa  66.6  6e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
1037 aa  66.6  6e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  21.92 
 
 
326 aa  66.2  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  32.88 
 
 
249 aa  65.5  1e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
257 aa  65.9  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
436 aa  65.5  1e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
222 aa  65.5  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  25.99 
 
 
313 aa  65.1  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
348 aa  64.7  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  28.67 
 
 
199 aa  65.5  2e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  64.7  2e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.24117e-08  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
298 aa  64.3  3e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
442 aa  64.3  3e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  28.27 
 
 
324 aa  64.3  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.68 
 
 
303 aa  64.3  3e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  1.29076e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  22.26 
 
 
326 aa  64.7  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 
239 aa  63.5  5e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.41 
 
 
303 aa  63.2  6e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
351 aa  63.5  6e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
219 aa  62.8  8e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
1523 aa  62.8  9e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.02 
 
 
303 aa  62.4  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
262 aa  62  1e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25 
 
 
304 aa  62.4  1e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.04 
 
 
245 aa  62  1e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  34 
 
 
265 aa  62.4  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.21 
 
 
247 aa  62.4  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>