241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3392 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3392  maltodextrin glucosidase  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  99.54 
 
 
609 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  98.61 
 
 
609 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  66.19 
 
 
607 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  56.19 
 
 
605 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  56.19 
 
 
605 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  56.19 
 
 
605 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  56.19 
 
 
605 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  56.6 
 
 
605 aa  247  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  55.71 
 
 
604 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  55.24 
 
 
605 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  55.24 
 
 
605 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  54.76 
 
 
605 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  54.76 
 
 
605 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  54.76 
 
 
605 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  54.76 
 
 
605 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  53.3 
 
 
605 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  41.52 
 
 
608 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 
614 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  49.66 
 
 
496 aa  138  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  42.03 
 
 
663 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  35.36 
 
 
617 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  35.58 
 
 
481 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  37.75 
 
 
493 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  40 
 
 
481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  32.98 
 
 
486 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  41.27 
 
 
481 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  39.74 
 
 
488 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  31.94 
 
 
486 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  39.13 
 
 
644 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 
487 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  32.81 
 
 
574 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  41.61 
 
 
580 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  29.96 
 
 
575 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  37.16 
 
 
481 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  36.42 
 
 
484 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  32.93 
 
 
576 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  30.18 
 
 
586 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  30.18 
 
 
586 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  30.18 
 
 
586 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  30.18 
 
 
586 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  30.18 
 
 
586 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  34.55 
 
 
596 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  30.18 
 
 
586 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  39.2 
 
 
588 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  38.89 
 
 
479 aa  99  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  36.36 
 
 
481 aa  98.6  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.18 
 
 
586 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  37.9 
 
 
586 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  38.36 
 
 
486 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  32.8 
 
 
590 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  29.59 
 
 
586 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  35.82 
 
 
589 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  33.86 
 
 
477 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  34.21 
 
 
587 aa  95.5  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  42.11 
 
 
608 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  31.19 
 
 
624 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 
647 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  36.29 
 
 
586 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  33.33 
 
 
610 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  40.95 
 
 
475 aa  91.7  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  30 
 
 
634 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  30.59 
 
 
569 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 
474 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  29.11 
 
 
610 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  31.08 
 
 
582 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  37.4 
 
 
586 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  32.12 
 
 
586 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  45.24 
 
 
584 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  30 
 
 
609 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  33.79 
 
 
472 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  40.8 
 
 
655 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 
473 aa  85.1  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  30.36 
 
 
473 aa  85.1  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  31.52 
 
 
1643 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  29.25 
 
 
459 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  31.76 
 
 
576 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  33.58 
 
 
611 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 
659 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.85 
 
 
606 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  33.88 
 
 
510 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 
611 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  37.27 
 
 
914 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  36.45 
 
 
578 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1060  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
431 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60641e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1057  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000804906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1238  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1079  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
433 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000334423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1162  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
433 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  39.58 
 
 
589 aa  74.7  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0875  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
440 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1270  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000443122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1314  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000103321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.65 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.75 
 
 
511 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.63 
 
 
1175 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4130  alpha-amylase family protein  28.97 
 
 
431 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000772856  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  28.42 
 
 
727 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1211  alpha-amylase family protein  28.97 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.019383  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  29.41 
 
 
600 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>