223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1634 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  98.54 
 
 		 342 aa  677    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  720    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  68.5 
 
 		 346 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  76.04 
 
 		 313 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  55.52 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  54.84 
 
 		 348 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  50.7 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  56.97 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.52 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  53.11 
 
 		 323 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  47.66 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  47.83 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.07 
 
 		 342 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  46.89 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.47 
 
 		 345 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.94 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  46.77 
 
 		 346 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  45.65 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.8 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.52 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  47.52 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  47.52 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  47.52 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  47.52 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  45.65 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.68 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  47.52 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  47.35 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  46.89 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.2 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.45 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  47.2 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.2 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  47.2 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  47.2 
 
 		 342 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.45 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.55 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  44.86 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.51 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  46.58 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  46.58 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  46.58 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  46.58 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  46.58 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.61 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  44.1 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  43.75 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.77 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  41.43 
 
 		 342 aa  275  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  44.97 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  44.34 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  42.95 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.12 
 
 		 337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  45.42 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  39.74 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.54 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.98 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  37.66 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.64 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.64 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.95 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.39 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.77 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  38.75 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  36.42 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.46 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.78 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  37.78 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  39.25 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.19 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.28 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.49 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.03 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.92 
 
 		 454 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.73 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  40.07 
 
 		 368 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.53 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.92 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  38.2 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.97 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.37 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  35.71 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.34 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  34.92 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.79 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.69 
 
 		 437 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.28 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.24 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.31 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  31.4 
 
 		 527 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  32.92 
 
 		 483 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  33.74 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  35.19 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.524387 
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  31.03 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.64 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.96 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  31.03 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.27 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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