227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0453 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 
363 aa  726    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  66.38 
 
 
350 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.12 
 
 
356 aa  461  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.8 
 
 
350 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  66.18 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.51 
 
 
362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.79 
 
 
347 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  62.33 
 
 
363 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  60 
 
 
366 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  62.67 
 
 
363 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  64.04 
 
 
364 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.87 
 
 
347 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.56 
 
 
356 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  62.14 
 
 
356 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.63 
 
 
353 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.52 
 
 
353 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.05 
 
 
353 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  61.8 
 
 
366 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  62.4 
 
 
363 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  61.71 
 
 
368 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  57.73 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  54.75 
 
 
324 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.43 
 
 
366 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.33 
 
 
382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  51.59 
 
 
340 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.15 
 
 
345 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  51.59 
 
 
340 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.84 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.77 
 
 
403 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  44.83 
 
 
353 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.81 
 
 
358 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  43.34 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.36 
 
 
393 aa  269  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  42.99 
 
 
416 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.66 
 
 
344 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  41.55 
 
 
438 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  42.86 
 
 
420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.97 
 
 
437 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.9 
 
 
346 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.31 
 
 
419 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  46.01 
 
 
347 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  43.03 
 
 
457 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  42.81 
 
 
453 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.99 
 
 
344 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  42.19 
 
 
527 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.48 
 
 
427 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.12 
 
 
437 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.99 
 
 
437 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.71 
 
 
347 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  41.8 
 
 
439 aa  258  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.46 
 
 
460 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.85 
 
 
440 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.19 
 
 
407 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 
439 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.68 
 
 
454 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.46 
 
 
437 aa  255  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40 
 
 
433 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  40.17 
 
 
454 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.95 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.3 
 
 
341 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  39.26 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.19 
 
 
411 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  45.31 
 
 
344 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.84 
 
 
440 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  39 
 
 
416 aa  251  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.14 
 
 
423 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  40.91 
 
 
435 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  39.66 
 
 
730 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  40.84 
 
 
730 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  39.94 
 
 
708 aa  249  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.37 
 
 
433 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.52 
 
 
413 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.43 
 
 
436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.94 
 
 
420 aa  245  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.81 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.46 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.88 
 
 
396 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.52 
 
 
472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  37.24 
 
 
483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.52 
 
 
472 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.53 
 
 
406 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.46 
 
 
437 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  36.23 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.84 
 
 
402 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  40.84 
 
 
402 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.84 
 
 
402 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.5 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  37.64 
 
 
414 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40 
 
 
385 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.72 
 
 
413 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  41.45 
 
 
375 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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