227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5662 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  98.54 
 
 
342 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  97.08 
 
 
342 aa  685    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  97.95 
 
 
342 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  97.66 
 
 
342 aa  690    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  98.25 
 
 
342 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  98.83 
 
 
349 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  98.54 
 
 
342 aa  697    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  100 
 
 
342 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  88.86 
 
 
342 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  97.95 
 
 
342 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  88.56 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  88.56 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  88.56 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  88.56 
 
 
342 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  88.27 
 
 
342 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  76.61 
 
 
351 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  75.66 
 
 
348 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  75.44 
 
 
345 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  73.61 
 
 
342 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  72.43 
 
 
342 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  72.51 
 
 
348 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  72.59 
 
 
334 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  72.59 
 
 
334 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  67.06 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  66.18 
 
 
340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  64.62 
 
 
340 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  65.59 
 
 
340 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  59.76 
 
 
339 aa  427  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  59.04 
 
 
337 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.06 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  54.68 
 
 
342 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.76 
 
 
341 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  53.85 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.94 
 
 
337 aa  351  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  52.91 
 
 
342 aa  351  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  52.91 
 
 
342 aa  351  1e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.06 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.95 
 
 
340 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  48.48 
 
 
335 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  48.02 
 
 
346 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  51.08 
 
 
348 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  48.17 
 
 
335 aa  316  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  50 
 
 
348 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  47.66 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.63 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  48 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  48.9 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  49.22 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.46 
 
 
372 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.52 
 
 
342 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  47.52 
 
 
357 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.48 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.14 
 
 
348 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  51.4 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  44.98 
 
 
323 aa  275  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  43.79 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.1 
 
 
362 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  37.12 
 
 
527 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.62 
 
 
403 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  40.14 
 
 
324 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.33 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  39.7 
 
 
366 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.4 
 
 
436 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.47 
 
 
437 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.8 
 
 
363 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.63 
 
 
325 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.28 
 
 
440 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.88 
 
 
454 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.65 
 
 
396 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  39.18 
 
 
364 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.44 
 
 
433 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  36.12 
 
 
457 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.86 
 
 
440 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  32.41 
 
 
416 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.11 
 
 
353 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.47 
 
 
437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.89 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.42 
 
 
353 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  37.74 
 
 
340 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.38 
 
 
356 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  36.81 
 
 
363 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.08 
 
 
411 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.85 
 
 
356 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  35.69 
 
 
483 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.54 
 
 
427 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  35.98 
 
 
344 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  39.41 
 
 
340 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  32.52 
 
 
433 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  37.68 
 
 
368 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  35.99 
 
 
349 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.77 
 
 
350 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  33.84 
 
 
416 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.85 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.52 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.43 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.77 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.93 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.03 
 
 
345 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.77 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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