225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0988 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  995    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  54.52 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.89 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  54.59 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.89 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.9 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  50.84 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  50.71 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.1 
 
 		 403 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.57 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  50.94 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.57 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.52 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.04 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  49.15 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.73 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.75 
 
 		 406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.07 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  53.06 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.02 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.39 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  53.91 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.39 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.03 
 
 		 460 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.19 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  52.17 
 
 		 730 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.22 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.73 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.07 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  52.17 
 
 		 708 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  52.45 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.26 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.32 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.67 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  52.51 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.75 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  51.94 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  51.36 
 
 		 730 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  50.52 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.74 
 
 		 454 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.99 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.13 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  52.79 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  50.28 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.42 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.8 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  49.43 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  47.68 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  47.04 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  46.88 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  46.87 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.32 
 
 		 413 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.79 
 
 		 408 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.8 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.29 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.19 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.68 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  44.29 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.58 
 
 		 419 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.58 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.87 
 
 		 344 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  49.4 
 
 		 347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.65 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  45.65 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.46 
 
 		 422 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.44 
 
 		 344 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  47.26 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.11 
 
 		 402 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  48.42 
 
 		 353 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.53 
 
 		 374 aa  309  9e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.28 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.18 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.65 
 
 		 358 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  50.17 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.47 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  40.46 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  42.12 
 
 		 393 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  40.46 
 
 		 340 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.18 
 
 		 345 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.56 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  43.61 
 
 		 366 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  39.59 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.11 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  44.71 
 
 		 366 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  42.62 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.96 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  43 
 
 		 363 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  45.04 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.25 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  40 
 
 		 349 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.66 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.71 
 
 		 350 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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