227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1321 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  54.04 
 
 		 335 aa  345  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  61.32 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  52.47 
 
 		 356 aa  331  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.11 
 
 		 342 aa  325  5e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  53.11 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  56.04 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.35 
 
 		 348 aa  318  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  51.7 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.23 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.23 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.92 
 
 		 351 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.62 
 
 		 342 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  49.07 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  45.4 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.56 
 
 		 346 aa  312  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  45.71 
 
 		 340 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  48.76 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  45.09 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.31 
 
 		 342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  56.29 
 
 		 313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.31 
 
 		 342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  45.09 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  48.31 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  48.31 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  47.99 
 
 		 349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  45.06 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  48 
 
 		 342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.17 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  47.69 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  47.38 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  47.38 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  47.38 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.22 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  45.4 
 
 		 340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  47.65 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  47.71 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  47.71 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  47.71 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  47.71 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.71 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  47.71 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
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NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  47.02 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  47.71 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  44.48 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  47.4 
 
 		 342 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  47.9 
 
 		 323 aa  298  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.58 
 
 		 355 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.79 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  45.54 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  43.63 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.06 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.37 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.45 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.23 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  46.5 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.49 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  40.14 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  42.91 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.69 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.73 
 
 		 353 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  40.14 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.73 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.66 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  38.36 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.03 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.91 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  42.86 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  41.52 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.19 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  36.76 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.97 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.45 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.9 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  40.13 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.18 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  43.18 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  40.68 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.67 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.8 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.81 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  38.7 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.18 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.62 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.34 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.33 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  40.3 
 
 		 363 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.77 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.36 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  32.72 
 
 		 527 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.26 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.11 
 
 		 427 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  33.85 
 
 		 483 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  34.37 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.87 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  33.64 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  33.63 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.44 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  33.23 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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