225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00138 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  93.24 
 
 		 340 aa  663    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  100 
 
 		 340 aa  704    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  77.94 
 
 		 340 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  70.29 
 
 		 340 aa  514  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  65.59 
 
 		 342 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  65.29 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.53 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  64.41 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  65.37 
 
 		 349 aa  454  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  64.71 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  64.71 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  64.71 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  64.41 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  62.94 
 
 		 342 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  64.41 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  63.83 
 
 		 334 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.83 
 
 		 334 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  62.06 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  62.06 
 
 		 342 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  62.06 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  62.06 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.29 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61 
 
 		 351 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  62.65 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  61.76 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.83 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.54 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.64 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.23 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  52.79 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  57.32 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  53.69 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  51.85 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.85 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  49.85 
 
 		 342 aa  338  8e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  49.54 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.62 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.23 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  45.4 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  50.31 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.42 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  45.62 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  45.71 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  45.99 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  45.79 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.09 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  44.21 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.86 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  44.86 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  45.48 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  44.86 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  46.01 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.53 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  46.67 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  42.07 
 
 		 305 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.72 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.63 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.28 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  32 
 
 		 527 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  32.01 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.61 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.07 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.1 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.45 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.79 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  36.43 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  32.41 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  35.58 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  34.37 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.81 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  34.69 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  32.42 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.78 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  35.47 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.6 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.63 
 
 		 440 aa  175  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  29.94 
 
 		 416 aa  174  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.45 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  31.79 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.8 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  35.14 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.94 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  34.6 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.44 
 
 		 437 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.14 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  32.42 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  32.51 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.38 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.71 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
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NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.52 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.33 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.93 
 
 		 437 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.29 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.53 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.4 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  34.26 
 
 		 324 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  30.56 
 
 		 473 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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