232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3283 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 337 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  57.66 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  55.75 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  54.24 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  53.94 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  53.94 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  53.94 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  53.94 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  52.73 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  53.64 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  52.73 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  53.33 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  53.64 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  53.03 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.03 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  53.03 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.73 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  52.85 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  53.33 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.17 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.75 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.54 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  52.85 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.73 
 
 		 348 aa  361  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.24 
 
 		 341 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  52.85 
 
 		 340 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.42 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  50.91 
 
 		 342 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.72 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  51.72 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.71 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  52.63 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.11 
 
 		 340 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  49.22 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  49.22 
 
 		 342 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  50.76 
 
 		 339 aa  325  1e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  47.52 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.89 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  48.45 
 
 		 346 aa  311  9e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  48.92 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.65 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  46.25 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  47.52 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  46.23 
 
 		 323 aa  299  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  47.28 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  46.42 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.44 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.43 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  46.11 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  43.12 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  44.51 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.4 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.83 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 313 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  43.17 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  39.59 
 
 		 305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.98 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.55 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.06 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.82 
 
 		 437 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  31.78 
 
 		 527 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  33.75 
 
 		 473 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  33.75 
 
 		 473 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.84 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 473 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 473 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 473 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 473 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 473 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 473 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  33.44 
 
 		 473 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.74 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.44 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  31.8 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  31.58 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.4 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.23 
 
 		 433 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.97 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  31.35 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.27 
 
 		 382 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.87 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.03 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.66 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.99 
 
 		 437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  31.37 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  33.01 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  31.19 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.27 
 
 		 422 aa  178  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  32.82 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  31.78 
 
 		 420 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.01 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.2 
 
 		 433 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.51 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.87 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.3 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  33.58 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.44 
 
 		 460 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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