226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1231 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 348 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.23 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.17 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  59.94 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  55.9 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  54.84 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.55 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  58.81 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  59.42 
 
 		 313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  57.45 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  52.17 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  52.17 
 
 		 342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.06 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  49.43 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.19 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  48.91 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.7 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  49.28 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  50.3 
 
 		 342 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  51.86 
 
 		 334 aa  322  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.86 
 
 		 334 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  50 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  50 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.7 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  49.7 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  50.93 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  49.7 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  49.7 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.7 
 
 		 342 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.29 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  49.24 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.89 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  46.3 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.55 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  47.98 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  45.92 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.29 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  47.98 
 
 		 340 aa  312  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.24 
 
 		 348 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.24 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  49.07 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  49.07 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  49.07 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  49.07 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  45.79 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.39 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  48.76 
 
 		 342 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  46.6 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  46.3 
 
 		 335 aa  288  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  44.27 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  47.66 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  47.35 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  49.31 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.44 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.51 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  42.33 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.86 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.19 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.19 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.55 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  43.48 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.48 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.04 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  43.14 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  42.19 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.61 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.33 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.42 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.69 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.12 
 
 		 356 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.8 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.01 
 
 		 356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.13 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.07 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.78 
 
 		 363 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  39.73 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  40.12 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  36.42 
 
 		 527 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.68 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.35 
 
 		 460 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.2 
 
 		 419 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  42.32 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.27 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  43.02 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.55 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.33 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.08 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  42.7 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.53 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.35 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.35 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  39.45 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  34.15 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  37.35 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  39.25 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.46 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  38.96 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.69 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.39 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  37.83 
 
 		 483 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>