224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3939 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 
419 aa  843    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.52 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  52.43 
 
 
416 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  51.1 
 
 
420 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  48.4 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.55 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.69 
 
 
436 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.69 
 
 
423 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.73 
 
 
422 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.53 
 
 
420 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  49.44 
 
 
439 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  49.72 
 
 
439 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  47.49 
 
 
439 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  52.66 
 
 
438 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  48.45 
 
 
483 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.6 
 
 
472 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.73 
 
 
440 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.34 
 
 
437 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  47.78 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  49.17 
 
 
414 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  50.82 
 
 
457 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  49.74 
 
 
454 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  47.78 
 
 
473 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.77 
 
 
413 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.5 
 
 
472 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  50.14 
 
 
375 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.14 
 
 
415 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  47.5 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.21 
 
 
427 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.93 
 
 
402 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.83 
 
 
437 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.2 
 
 
402 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.86 
 
 
415 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.25 
 
 
437 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.82 
 
 
396 aa  364  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.48 
 
 
403 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.15 
 
 
437 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.2 
 
 
460 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.32 
 
 
437 aa  362  8e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.58 
 
 
454 aa  361  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.69 
 
 
433 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.02 
 
 
427 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  49.87 
 
 
402 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.06 
 
 
406 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  48.34 
 
 
730 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.59 
 
 
413 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  48.07 
 
 
708 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  47.71 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  44.53 
 
 
433 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.77 
 
 
433 aa  353  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.77 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  46.81 
 
 
422 aa  353  4e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.46 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  46.09 
 
 
730 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  49.44 
 
 
453 aa  349  6e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.43 
 
 
407 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  43.79 
 
 
412 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  44.99 
 
 
527 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.9 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  44.76 
 
 
415 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  51 
 
 
347 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.74 
 
 
419 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.67 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.6 
 
 
411 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.75 
 
 
346 aa  322  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.31 
 
 
381 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.45 
 
 
374 aa  315  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.94 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  52.01 
 
 
344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.32 
 
 
365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.14 
 
 
347 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  49.71 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.59 
 
 
344 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.03 
 
 
344 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.68 
 
 
341 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.05 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  47.59 
 
 
360 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.34 
 
 
358 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.3 
 
 
356 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.6 
 
 
345 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.48 
 
 
356 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.16 
 
 
347 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  43.29 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  46.13 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  45.12 
 
 
366 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.31 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  41.51 
 
 
393 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.94 
 
 
356 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  39.94 
 
 
397 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.87 
 
 
353 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal 
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.48 
 
 
353 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.57 
 
 
366 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.792489 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  43.29 
 
 
340 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.75 
 
 
353 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.486913 
 
 
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