228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0898 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 340 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  51.88 
 
 		 340 aa  342  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  51.88 
 
 		 340 aa  338  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  50 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  48.35 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  50.62 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.17 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  51.1 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  48.95 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.35 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  48.65 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  48.65 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  48.35 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  48.35 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.38 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.38 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.16 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  48.35 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  50.47 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.56 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.38 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  48.22 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  47.13 
 
 		 342 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  49.07 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.07 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.05 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  47.59 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  47.59 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  48.05 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  47.59 
 
 		 342 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  48.91 
 
 		 342 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.01 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.45 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  49.54 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  47.29 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  47.19 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.04 
 
 		 372 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.11 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
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NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  48.93 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
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NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  45.77 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  45.77 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  46.39 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  43.67 
 
 		 339 aa  297  1e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  46.71 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  45.68 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.42 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  47.7 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.08 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  42.45 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  42.77 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.08 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
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NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.66 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  42.15 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  42.15 
 
 		 326 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  42.52 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  40.74 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.23 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.9 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.59 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  33.13 
 
 		 439 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  30.75 
 
 		 527 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  35.45 
 
 		 366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  33.13 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.92 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  34.29 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  34.43 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  35.07 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.22 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  34.5 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.62 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.88 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.63 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.21 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.77 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.7 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.23 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.27 
 
 		 396 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.63 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  32.5 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.36 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  32.85 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  31.99 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  33.59 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.94 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.95 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.7 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.2 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  30.98 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  30.33 
 
 		 708 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.07 
 
 		 437 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  28.88 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.67 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.15 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.47 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  34.62 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  32.84 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.524387 
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  30.33 
 
 		 730 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.09 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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