232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1288 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 337 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  58.73 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.24 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.64 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  57.83 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.83 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  57.83 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.46 
 
 		 345 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  59.04 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  58.13 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  58.13 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  59.04 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  58.88 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.83 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  57.83 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  58.13 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  57.83 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  57.83 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  58.38 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  57.53 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.07 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  58.07 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.13 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  58.57 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  57.94 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.89 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  56.5 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  57.32 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.89 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  52.48 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  52.37 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.58 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  49.53 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  49.38 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  49.38 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.63 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  49.69 
 
 		 326 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  51.08 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.54 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  49.38 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  47.52 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.79 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  48.59 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  48.1 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  44.11 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  44.27 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.97 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  43.63 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.95 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
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NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.14 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  45.81 
 
 		 323 aa  271  8.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.69 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.95 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  42.95 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  43.87 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  37.86 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.53 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.51 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  35.94 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.59 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.39 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  35.31 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.08 
 
 		 454 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.14 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  34.84 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  34.16 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.95 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  34.19 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  36.28 
 
 		 708 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.38 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.81 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  33.75 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  35.14 
 
 		 483 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.75 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.61 
 
 		 411 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.69 
 
 		 437 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  35.09 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  36.28 
 
 		 730 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.77 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.6 
 
 		 413 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  31.55 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  35.6 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.7 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.98 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.08 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  31.96 
 
 		 527 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  32.62 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  32.33 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.21 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.25 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  35.4 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  33.65 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.66 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.66 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  36.84 
 
 		 435 aa  175  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  35.25 
 
 		 415 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  37.59 
 
 		 438 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  37.96 
 
 		 730 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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