227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2235 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  701    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  79.71 
 
 		 340 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  77.94 
 
 		 340 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  74.12 
 
 		 340 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  66.18 
 
 		 342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  66.18 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  66.18 
 
 		 342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.88 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.88 
 
 		 342 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  66.18 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  65.88 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  65.88 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  65.88 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.1 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  64.41 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  65.67 
 
 		 349 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  64.81 
 
 		 348 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  64.95 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.38 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  64.95 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  63.24 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  62.94 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  62.94 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  64.12 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  62.94 
 
 		 342 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  62.65 
 
 		 342 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.09 
 
 		 345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.41 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.41 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  54.87 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  56.5 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  53.96 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  53.82 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  53.52 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  53.7 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.38 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.85 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  52.81 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
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NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.38 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  48.91 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  48.07 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  48.12 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  48.16 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
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NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  46.88 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.21 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  45.4 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.65 
 
 		 342 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.88 
 
 		 348 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  45.65 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  47.6 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.54 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  46.11 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  46.11 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  48.77 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  41.72 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.11 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.54 
 
 		 403 aa  195  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.3 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.39 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.34 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.33 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.64 
 
 		 454 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  38.02 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.76 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  37.92 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 527 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.45 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.64 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  32.2 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  37.64 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  33.74 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  36.7 
 
 		 366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.14 
 
 		 440 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  31.79 
 
 		 420 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  32.72 
 
 		 439 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.26 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.38 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  36.98 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.73 
 
 		 437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  35.99 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  31.79 
 
 		 416 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  34.46 
 
 		 483 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.72 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.15 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.31 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.45 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  32.1 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  33.54 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.76 
 
 		 346 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  34.38 
 
 		 366 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  33.94 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.15 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.52 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.19 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  31.82 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.98 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.79 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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