226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4730 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  99.71 
 
 		 342 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  99.42 
 
 		 342 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  100 
 
 		 342 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  99.42 
 
 		 342 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  99.42 
 
 		 342 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  88.27 
 
 		 342 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  88.27 
 
 		 342 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  88.27 
 
 		 342 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  88.27 
 
 		 342 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  87.98 
 
 		 342 aa  621  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  87.68 
 
 		 342 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  88.27 
 
 		 342 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  87.39 
 
 		 342 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  85.92 
 
 		 342 aa  614  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  87.72 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  76.25 
 
 		 351 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  75.37 
 
 		 348 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  73.9 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  74.78 
 
 		 345 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  73.31 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  73.27 
 
 		 334 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  73.27 
 
 		 334 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  72.43 
 
 		 348 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  63.82 
 
 		 340 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  63.24 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  61.18 
 
 		 340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  62.06 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  59.76 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  58.88 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.59 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  54.46 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.36 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.64 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  50.75 
 
 		 342 aa  348  8e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  50.75 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  52.92 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.85 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  47.32 
 
 		 335 aa  315  6e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.91 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  48.29 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  47.62 
 
 		 335 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  50.77 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  48.29 
 
 		 346 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  47.71 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  48.76 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.83 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.71 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  48.44 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  47.81 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  52.8 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  46.58 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.75 
 
 		 348 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.96 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  46.55 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  43.14 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.24 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  37.12 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  41.2 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.9 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.74 
 
 		 433 aa  198  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.69 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  39.86 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  38.75 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.89 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.94 
 
 		 460 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  36.76 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  33.44 
 
 		 433 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.74 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  38.04 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.89 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.85 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  32.1 
 
 		 416 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.69 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.85 
 
 		 436 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.68 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.74 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.13 
 
 		 433 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  35.38 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  39.18 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  39.92 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.64 
 
 		 454 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  39.16 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  34.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.76 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.38 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.37 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.86 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  35.64 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.81 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.74 
 
 		 437 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.96 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.82 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.57 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.28 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  35.67 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  32.92 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.13 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.62 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.8 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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