227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3673 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 334 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 334 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 342 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  82.16 
 
 		 342 aa  581  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  79.82 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  80.12 
 
 		 351 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  79.18 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  74.85 
 
 		 348 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  73.31 
 
 		 342 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  73.02 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  73.31 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  73.31 
 
 		 342 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  72.43 
 
 		 342 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  73.31 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  73.1 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  71.26 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  71.26 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  71.55 
 
 		 342 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  71.55 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  71.55 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  71.26 
 
 		 342 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  71.55 
 
 		 342 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  71.56 
 
 		 349 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  64.41 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  62.94 
 
 		 340 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  62.65 
 
 		 340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  61.18 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  61.24 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  57.53 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.08 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  53.99 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.35 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  55.38 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.91 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  48.94 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  48.94 
 
 		 342 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.62 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  49.28 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  50.15 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.22 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  48.62 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  52.01 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  47.66 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.54 
 
 		 372 aa  308  9e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  48.93 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  47.71 
 
 		 323 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.63 
 
 		 342 aa  301  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  48.9 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  47.98 
 
 		 326 aa  288  9e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  47.2 
 
 		 357 aa  288  9e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.58 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.6 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  51.05 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  45.61 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  42.07 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.6 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  34.97 
 
 		 527 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.47 
 
 		 437 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.41 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  38.26 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  37.15 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  35.8 
 
 		 483 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  37.02 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.16 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  39.77 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.03 
 
 		 460 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.93 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  35.98 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.2 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  38.41 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  33.54 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.64 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.8 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.61 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.72 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.08 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.39 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.36 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.54 
 
 		 472 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  33.54 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.29 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.93 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.54 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.87 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.54 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.5 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  31.8 
 
 		 416 aa  179  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  33.23 
 
 		 473 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  31.29 
 
 		 433 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  38.55 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.46 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.89 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
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