235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0464 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



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Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 348 aa  692    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  60.17 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  53.8 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  56.66 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.52 
 
 		 342 aa  345  6e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  54.52 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.04 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  60.35 
 
 		 323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  59.32 
 
 		 348 aa  335  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  50.31 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  50.31 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.43 
 
 		 355 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  56.41 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  46.88 
 
 		 340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.69 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.19 
 
 		 341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.39 
 
 		 348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.88 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.66 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
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CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.66 
 
 		 342 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  46.25 
 
 		 340 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  47.98 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  47.66 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  47.98 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  47.66 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  48.14 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  48.6 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  48.6 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  48.15 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.6 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  47.04 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
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NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.98 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
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NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  47.83 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.66 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  47.04 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  46.56 
 
 		 342 aa  296  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.69 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  46.67 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  46.67 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  46.67 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  46.25 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.31 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  46.75 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  45.14 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  45 
 
 		 340 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  46.36 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  43.94 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  47.84 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  47.84 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  47.84 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.94 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  49.12 
 
 		 323 aa  281  8.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  46.91 
 
 		 335 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.43 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.25 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  41.45 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.3 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.41 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.01 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.14 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  43.51 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.07 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.86 
 
 		 345 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  43.86 
 
 		 340 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.82 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.43 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  40.12 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.65 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.91 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.44 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.12 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.94 
 
 		 356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.65 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.11 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  44.49 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.7 
 
 		 350 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  39.53 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  43.35 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.46 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  43.84 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.35 
 
 		 460 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.01 
 
 		 454 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.95 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  41.46 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  36.28 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  38.79 
 
 		 527 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  38.51 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.23 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  36.02 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.64 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.92 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  39.26 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.18 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.09 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  34.46 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  35.09 
 
 		 416 aa  185  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.89 
 
 		 344 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.97 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.46 
 
 		 433 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.07 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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