226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1081 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 346 aa  709    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  55.52 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  54.18 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  52.81 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  51.56 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.65 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.24 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  51.1 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  51.1 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  53.73 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  49.43 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.06 
 
 		 351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  51.25 
 
 		 340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.4 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.77 
 
 		 342 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.61 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.09 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  50.15 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  51.06 
 
 		 335 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  51.4 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.4 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  51.08 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  52.48 
 
 		 335 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  48.79 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  48.79 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  49.69 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  48.94 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.48 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  48.33 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  48.33 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  51.55 
 
 		 335 aa  326  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  50.31 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.33 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.62 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.76 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  48.33 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.93 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  49.38 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  47.72 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  48.29 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  48.29 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  48.29 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  48.29 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.62 
 
 		 372 aa  315  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  47.98 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  47.52 
 
 		 342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.43 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
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NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  51.24 
 
 		 326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.77 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  46.77 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  50.31 
 
 		 326 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  48.06 
 
 		 313 aa  298  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.45 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.15 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  49.12 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  42.47 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.75 
 
 		 433 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.74 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  36.45 
 
 		 433 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  37.23 
 
 		 457 aa  208  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.45 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.05 
 
 		 403 aa  205  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.98 
 
 		 437 aa  203  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.66 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.37 
 
 		 437 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.93 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.94 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.54 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.84 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.02 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  36.2 
 
 		 730 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  35.89 
 
 		 708 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.56 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  36.76 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  34.86 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.64 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.06 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  35.29 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.24 
 
 		 437 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.52 
 
 		 440 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  34.76 
 
 		 453 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  34.56 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  36.61 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.69 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.44 
 
 		 419 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  34.48 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  34.93 
 
 		 483 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.85 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  35.09 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  35.96 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  35.65 
 
 		 730 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.33 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  34.02 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.06 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  34.15 
 
 		 527 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.15 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.91 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  33.03 
 
 		 416 aa  186  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  34.35 
 
 		 414 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.58 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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