225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1649 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  69.53 
 
 
440 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  82.95 
 
 
438 aa  760    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  68.14 
 
 
435 aa  637    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 
437 aa  904    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  86.21 
 
 
437 aa  791    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  67.29 
 
 
437 aa  634    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  67.97 
 
 
437 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  65.06 
 
 
454 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  69.08 
 
 
457 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  65.78 
 
 
453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.05 
 
 
440 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  63.36 
 
 
708 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  63.12 
 
 
730 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  62.88 
 
 
730 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.71 
 
 
437 aa  551  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.81 
 
 
433 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.09 
 
 
433 aa  530  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.86 
 
 
433 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  58.33 
 
 
433 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.56 
 
 
427 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  54.18 
 
 
416 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  56.46 
 
 
414 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  53.59 
 
 
420 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.33 
 
 
422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.7 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.39 
 
 
472 aa  441  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  53.24 
 
 
416 aa  437  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.02 
 
 
436 aa  435  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  52.03 
 
 
473 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  52.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.91 
 
 
472 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.14 
 
 
406 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.33 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.77 
 
 
420 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  53.24 
 
 
375 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.96 
 
 
415 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.96 
 
 
415 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  54.32 
 
 
483 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.39 
 
 
413 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.1 
 
 
454 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.44 
 
 
413 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.41 
 
 
419 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  47.77 
 
 
412 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.99 
 
 
432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.01 
 
 
427 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.43 
 
 
407 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.44 
 
 
403 aa  360  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.17 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  46.07 
 
 
422 aa  352  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  45.88 
 
 
439 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  45.57 
 
 
527 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  44.09 
 
 
415 aa  350  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  46.67 
 
 
439 aa  346  4e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 
439 aa  346  5e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.68 
 
 
411 aa  346  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.81 
 
 
422 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.41 
 
 
419 aa  335  9e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.89 
 
 
396 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.01 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.01 
 
 
344 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.43 
 
 
408 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.14 
 
 
385 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  48.72 
 
 
344 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  48.42 
 
 
353 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  46.99 
 
 
347 aa  316  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.84 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.6 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.42 
 
 
374 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  44.11 
 
 
402 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.77 
 
 
347 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.56 
 
 
402 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.15 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.22 
 
 
381 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.2 
 
 
358 aa  299  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  45.94 
 
 
360 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.81 
 
 
341 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.75 
 
 
362 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.97 
 
 
363 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.6 
 
 
366 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  44.34 
 
 
393 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  38.46 
 
 
397 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.47 
 
 
356 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.97 
 
 
345 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.05 
 
 
356 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  37.32 
 
 
340 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  37.97 
 
 
340 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.42 
 
 
353 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.26 
 
 
356 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  41.47 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  38.86 
 
 
349 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  41.81 
 
 
366 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.07 
 
 
350 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.8 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal 
 
 
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