224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0971 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  54.55 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  54.68 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.8 
 
 		 342 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  54.09 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  54.09 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  53.51 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.8 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.75 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  52.79 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  53.51 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  54.28 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.09 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  52.2 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  55.08 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  53.96 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.9 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  53.8 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.94 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.23 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  54.46 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  54.46 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  53.99 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  54.46 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  53.99 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.99 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  54.46 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  54.15 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.75 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.75 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
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NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  52.01 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  52.48 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  53.73 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  49.54 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  49.54 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  50.46 
 
 		 339 aa  338  8e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.23 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  47.89 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  46.3 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  45.06 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.19 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  47.96 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  47.65 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  49.38 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  47.32 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.65 
 
 		 372 aa  295  6e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  46.43 
 
 		 335 aa  291  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.31 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.56 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.3 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.43 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  41.43 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  43.41 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  44.19 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  39.73 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.21 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.01 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.87 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.08 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.69 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.52 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.76 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  35.38 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.09 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.43 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  34.21 
 
 		 435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.19 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.08 
 
 		 436 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  33.95 
 
 		 527 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.89 
 
 		 460 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  37.45 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  36.54 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.82 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  36.63 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  34.46 
 
 		 344 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.16 
 
 		 437 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.37 
 
 		 427 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.87 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  37.36 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  37.17 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.47 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  38.95 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  35.99 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  34.05 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.21 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  32.32 
 
 		 453 aa  189  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  37.73 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.22 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  31.29 
 
 		 454 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  33.75 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.05 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.04 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.64 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.36 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  34.15 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.54 
 
 		 437 aa  185  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.04 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
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