224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1742 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1742  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  47.9 
 
 		 323 aa  298  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2627  hypothetical protein  51.06 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  46.33 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1081  L-lysine 2,3-aminomutase  49.12 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  46.33 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  48.61 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  48.89 
 
 		 348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1231  Lysine 2,3-aminomutase  49.31 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  48.77 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  44.98 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  46 
 
 		 340 aa  275  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  44.98 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  44.98 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  44.66 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4703  KamA family protein  44.66 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.07 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.66 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  44.98 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.72 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
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NC_010717  PXO_00383  lysine 2,3-aminomutase  48.59 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  45.81 
 
 		 337 aa  271  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3846  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.34 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  47.72 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.9 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.43 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.9 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  44.66 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.12 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  46.55 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  46.55 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  46.55 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  46.55 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  43.31 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1577  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.42 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0971  hypothetical protein  44.19 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.09 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1634  hypothetical protein  45.42 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  46.21 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  45.61 
 
 		 342 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2743  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.18 
 
 		 346 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124935  normal  0.899358 
 
 
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NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.61 
 
 		 334 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  45.61 
 
 		 334 aa  261  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  45.14 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00138  lysine 2;3-aminomutase  46.67 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1980  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.71 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.44193  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  41.29 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.52 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0440  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.21 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.51 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03679  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.9 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0366  hypothetical protein  44.19 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0341  hypothetical protein  43.55 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  39.68 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.17 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  41.2 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  33.77 
 
 		 527 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.55 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.6 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.59 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  38.52 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.98 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.53 
 
 		 350 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.5 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  35.09 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.69 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.07 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  33.75 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.75 
 
 		 353 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.52 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.61 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.78 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.23 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.69 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.82 
 
 		 350 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.05 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.22 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.69 
 
 		 353 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.9 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.52 
 
 		 382 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.48 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.37 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  35.19 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.31 
 
 		 403 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  32.98 
 
 		 347 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  33.69 
 
 		 366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.1 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.98 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.98 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  31.49 
 
 		 416 aa  162  6e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  34.4 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  33.23 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.07 
 
 		 460 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  31.21 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  33.81 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.21 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.21 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.45 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.6 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  29.64 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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