225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_569 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  89.75 
 
 		 439 aa  818    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 439 aa  914    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  90.89 
 
 		 439 aa  842    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.1 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  49.45 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.44 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.14 
 
 		 422 aa  382  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.24 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  48.61 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.21 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  47.93 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.7 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.65 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.74 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.9 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  47.15 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.74 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  47.66 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.33 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.88 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  47.28 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  46.36 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.11 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.1 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  47.9 
 
 		 375 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.56 
 
 		 437 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.67 
 
 		 415 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.67 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.11 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  46.37 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.61 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.45 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  47.63 
 
 		 730 aa  359  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.42 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  47.77 
 
 		 730 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.11 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.32 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  47.35 
 
 		 708 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  47.68 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.3 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  47.57 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.18 
 
 		 413 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  45.24 
 
 		 457 aa  349  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  47.47 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  46.39 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.67 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  44.3 
 
 		 453 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.95 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.48 
 
 		 419 aa  342  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.9 
 
 		 411 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.18 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.88 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.11 
 
 		 374 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.43 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.38 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  45.78 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  43.47 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.36 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.38 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.84 
 
 		 346 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.21 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  40 
 
 		 412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.23 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.21 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.22 
 
 		 385 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  43.21 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  47.41 
 
 		 353 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.17 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  47.16 
 
 		 347 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.29 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.85 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.56 
 
 		 344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  45.98 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.02 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  44.06 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.57 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.34 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.06 
 
 		 358 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40 
 
 		 353 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  38.81 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.43 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.98 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.97 
 
 		 347 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.7 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.69 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.93 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.7 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  42.76 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  40.69 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  40.8 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.82 
 
 		 345 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  37.6 
 
 		 393 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.1 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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